马来西亚大学研究生专业广泛，以私立大学马来西亚思特雅大学为例，该校研究生专业涵盖了生物技术硕士、生物技术与商业管理硕士、制药技术硕士、临床药学实习硕士、建筑学硕士、物流管理硕士、精算管理硕士等，公立院校马来西亚北方大学研究生专业则包含了理学硕士（工程学）、工商管理学硕士、临床心理学硕士、国际酒店管理硕士、医学硕士等。
马来西亚大学研究生专业
马来西亚思特雅大学研究生专业
应用科学：管理营养硕士、应用科学硕士，通过研究、生物技术硕士、生物技术与商业管理硕士、食品科学与商业管理硕士
健康老化、医学美学和再生医学学院：健康老化，医学美学和再生医学硕士
医药科学学院：药物化学硕士、制药技术硕士、临床药学实习硕士
工程、技术和建筑环境学院：工程哲学硕士
建筑和建筑环境学院：建筑学硕士
创意艺术及设计学院：艺术与设计硕士
音乐学院：音乐硕士（表演研究）
商业与信息科学学院：MBA、MBA（Bluve Ocean战略）、物流管理硕士、精算管理硕士
信息技术学院：科技创业硕士
TERENGGANU校园：MBA（石油，天然气管理）
社会科学和人文科学学院：儿童心理学硕士、临床心理学硕士
马来西亚泰莱大学研究生专业
硕士（授课型）：建筑学硕士；应用计算机硕士；传媒学硕士；工商管理学硕士；管理学硕士；国际酒店管理硕士；教学与学习硕士；虚拟设计建筑理学硕士；临床心理学硕士；
硕士（研究型）：理学硕士；医学硕士；理学硕士（电脑学）；理学硕士（工程学）；理学硕士（生物科学）；药剂；药剂科学；食品研究；教育学；设计学；
马来西亚北方大学研究生专业
1、人文与社会科学研究生院：教育学硕士，应用语言学硕士，理学硕士（咨询学）， 理学硕士, 理学硕士（管理沟通），理学硕士（教育管理），理学硕士（决策科学），理学硕士（智能系统），理学硕士（信息与通讯技术），理学硕士（信息技术），理学硕士（媒体管理），理学硕士（多媒体研究），文学硕士（当代马来语研究），理学硕士（数学），理学硕士（统计学），文学硕士（传媒学），文学硕士（社会工作），文学硕士（心理学），文学硕士（历史），文学硕士（伊斯兰研究）
2、商科研究生院：工商管理硕士，理学硕士（职业安全与健康管理），理学硕士（金融） , 理学硕士（伊斯兰金融和银行），理学硕士（运营管理），理学硕士（管理学），理学硕士（国际会计），理学硕士（银行学），理学硕士（保险）。
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